Výbor TJ ČZU je pětičlenný a zajišťuje právnické, administrativní a účetní záležitosti TJ ČZU. Schází se zpravidla jednou za čtvrt roku a jednou za rok svolává valnou hromadu TJ ČZU. Současně výbor TJ ČZU zajišťuje a koordinuje spolupráci TJ ČZU s ostatními složkami, především s Českou zemědělskou univerzitou a Českou asociací univerzitního sportu.
Výbor TJ ČZU pracuje v tomto složení:
- předseta TJ ČZU – Mgr. Igor Miklík
- místopředseda TJ ČZU – dr. Dušan Vavrla (zajišťuje spolupráci TJ s KTV ČZU)
- tajemník TJ ČZU – Mgr. Jozef Hrabovský (ekonomický úsek)
- člen výboru TJ ČZU – Mgr. Lucie Janíková (styk výboru TJ s jednotlivými oddíly)
- člen výboru TJ ČZU – Mgr. Radek Švejdar (statistika a evidence TJ)
Další funkce v TJ ČZU:
- účetní – Jarmila Bauerová
- pokladní – Helena Grebíková